Atividade 1
A atividade 1 consiste
em um exercício de construção de uma base de dados (planilha) a partir
de dados coletados em campo descritos em fichas
de campo simuladas com dados derivados do trabalho de Edgar
Anderson (Anderson E. 1935. The irises of the Gaspe Peninsula,
Bulletin of the American Iris Society, 59: 2–5).
Atividade 2
A atividade 2 será
realizada para padronizar os dados gerados na atividade 1 usando o
sistema Darwin Core e criar os
arquivos necessários para distribuição dos dados como Darwin
Core Arquive.
Atividade 3
A atividade 3 inclui
exercícios para a criação de uma rotina em R para a aquisição de dados
em bases abertas, neste caso, utilizando-se o GBIF. Além disso, serão apresentadas
ferramentas para conferência e limpeza de dados.
Atividade 4
A atividade 4 é uma
extensão da atividade 3,
onde os participantes terão de traduzir a rotina criada em R para uma
rotina comentada em RMarkdown indicando detalhes a respeito do processo
de aquisição e limpeza dos dados. Na segunda parte da atividade, serão
testadas ferramentas de compartilhamento no GitHub.
Atividade 5
A atividade 5 finaliza
o processo de ferramentas básicas de compartilhamento e
reprodutibilidade de dados científicos. Nesta atividade, os
participantes irão tranformar as rotinas criadas nas atividades
anteriores em um website além de incluir alguns chunck de
recursos interativos.
Extra
Exemplo 1 - banco de dados do iNaturalist
Exemplo 2 - usando gráficos animados.
Exemplo 3 - usando gráficos interativos.
Colabore, compartilhe, e cite as fontes!